MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017857	TGG	2	6	234480	234485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126122
4502	NC_017857	GAT	2	6	234520	234525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
4503	NC_017857	TTCAC	2	10	234557	234566	20 %	40 %	0 %	40 %	387126122
4504	NC_017857	TGC	2	6	234604	234609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126122
4505	NC_017857	GTGA	2	8	234624	234631	25 %	25 %	50 %	0 %	387126122
4506	NC_017857	TGG	2	6	234667	234672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126122
4507	NC_017857	ACG	2	6	234673	234678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126122
4508	NC_017857	TAA	2	6	234679	234684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126122
4509	NC_017857	TCA	2	6	234725	234730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
4510	NC_017857	GAT	2	6	234733	234738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
4511	NC_017857	AGC	2	6	234811	234816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126122
4512	NC_017857	GAT	2	6	234841	234846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
4513	NC_017857	AGA	2	6	234898	234903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126122
4514	NC_017857	TGAT	2	8	234953	234960	25 %	50 %	25 %	0 %	387126122
4515	NC_017857	CGAC	2	8	235028	235035	25 %	0 %	25 %	50 %	387126122
4516	NC_017857	ATC	2	6	235040	235045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
4517	NC_017857	GATT	2	8	235051	235058	25 %	50 %	25 %	0 %	387126122
4518	NC_017857	TGGT	2	8	235075	235082	0 %	50 %	50 %	0 %	387126122
4519	NC_017857	CAA	2	6	235185	235190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126122
4520	NC_017857	GACAT	2	10	235364	235373	40 %	20 %	20 %	20 %	387126122
4521	NC_017857	CTG	2	6	235491	235496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126122
4522	NC_017857	GCTTA	2	10	235532	235541	20 %	40 %	20 %	20 %	387126123
4523	NC_017857	CAG	2	6	235621	235626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126123
4524	NC_017857	T	6	6	235672	235677	0 %	100 %	0 %	0 %	387126123
4525	NC_017857	T	6	6	235698	235703	0 %	100 %	0 %	0 %	387126123
4526	NC_017857	TTA	2	6	235728	235733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126123
4527	NC_017857	ATT	2	6	235813	235818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126123
4528	NC_017857	AGC	2	6	235829	235834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126123
4529	NC_017857	AGCA	2	8	235876	235883	50 %	0 %	25 %	25 %	387126123
4530	NC_017857	TCA	2	6	235898	235903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126123
4531	NC_017857	AGC	2	6	235945	235950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126123
4532	NC_017857	GCGA	2	8	236038	236045	25 %	0 %	50 %	25 %	387126123
4533	NC_017857	TCA	2	6	236123	236128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126124
4534	NC_017857	TCA	2	6	236192	236197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126124
4535	NC_017857	TCG	2	6	236282	236287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126124
4536	NC_017857	TTC	2	6	236443	236448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126124
4537	NC_017857	GGC	2	6	236465	236470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126124
4538	NC_017857	CGA	2	6	236493	236498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126124
4539	NC_017857	GAGTT	2	10	236576	236585	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_017857	TACA	2	8	236614	236621	50 %	25 %	0 %	25 %	387126125
4541	NC_017857	GAA	2	6	236674	236679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126125
4542	NC_017857	ACC	2	6	236737	236742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126125
4543	NC_017857	GCA	2	6	236762	236767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126125
4544	NC_017857	ATC	2	6	236786	236791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126125
4545	NC_017857	TAAAC	2	10	236807	236816	60 %	20 %	0 %	20 %	387126125
4546	NC_017857	TC	3	6	236830	236835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_017857	A	7	7	236855	236861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_017857	ATG	2	6	236887	236892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126126
4549	NC_017857	CCATAT	2	12	236904	236915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126126
4550	NC_017857	TAA	3	9	236955	236963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126126
4551	NC_017857	TGG	2	6	237036	237041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126126
4552	NC_017857	AAC	2	6	237083	237088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126126
4553	NC_017857	ACC	2	6	237196	237201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126126
4554	NC_017857	CTTTGA	2	12	237207	237218	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387126126
4555	NC_017857	ATGCC	2	10	237252	237261	20 %	20 %	20 %	40 %	387126126
4556	NC_017857	GAA	2	6	237298	237303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126126
4557	NC_017857	TCA	2	6	237393	237398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126126
4558	NC_017857	ATC	2	6	237478	237483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126126
4559	NC_017857	TTGG	2	8	237521	237528	0 %	50 %	50 %	0 %	387126126
4560	NC_017857	GAA	2	6	237562	237567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126126
4561	NC_017857	CAT	2	6	237571	237576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126126
4562	NC_017857	GCT	2	6	237641	237646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126126
4563	NC_017857	ATC	2	6	237673	237678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126126
4564	NC_017857	GTT	2	6	237764	237769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126126
4565	NC_017857	TTC	2	6	237772	237777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126126
4566	NC_017857	CGA	2	6	237835	237840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126127
4567	NC_017857	CCTTG	2	10	238063	238072	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4568	NC_017857	TTA	2	6	238120	238125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_017857	TA	3	6	238212	238217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_017857	ATTT	2	8	238255	238262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017857	A	6	6	238270	238275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_017857	GCT	2	6	238280	238285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_017857	T	7	7	238308	238314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017857	TAAA	2	8	238319	238326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017857	TCA	2	6	238487	238492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126128
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4577	NC_017857	GCT	2	6	238578	238583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126128
4578	NC_017857	TTC	2	6	238597	238602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126128
4579	NC_017857	CGA	2	6	238655	238660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126128
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4581	NC_017857	CAT	3	9	238800	238808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126128
4582	NC_017857	TTC	2	6	238894	238899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126128
4583	NC_017857	TCAA	2	8	238961	238968	50 %	25 %	0 %	25 %	387126128
4584	NC_017857	CCAGC	2	10	239025	239034	20 %	0 %	20 %	60 %	387126128
4585	NC_017857	GCG	2	6	239053	239058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126128
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4588	NC_017857	TTC	2	6	239149	239154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126128
4589	NC_017857	T	7	7	239301	239307	0 %	100 %	0 %	0 %	387126128
4590	NC_017857	T	6	6	239351	239356	0 %	100 %	0 %	0 %	387126129
4591	NC_017857	GAT	2	6	239477	239482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126129
4592	NC_017857	TGAA	2	8	239483	239490	50 %	25 %	25 %	0 %	387126129
4593	NC_017857	ATT	2	6	239543	239548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126129
4594	NC_017857	GCA	2	6	239629	239634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126129
4595	NC_017857	AGTC	2	8	239639	239646	25 %	25 %	25 %	25 %	387126129
4596	NC_017857	ATA	2	6	239657	239662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126129
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4598	NC_017857	AGGG	2	8	239727	239734	25 %	0 %	75 %	0 %	387126129
4599	NC_017857	CGG	2	6	239833	239838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126129
4600	NC_017857	TTGG	2	8	239853	239860	0 %	50 %	50 %	0 %	387126129
4601	NC_017857	ATG	2	6	239892	239897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126129
4602	NC_017857	TGGCTT	2	12	239905	239916	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387126129
4603	NC_017857	CTG	2	6	239937	239942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126129
4604	NC_017857	ATCA	2	8	240002	240009	50 %	25 %	0 %	25 %	387126129
4605	NC_017857	AT	3	6	240103	240108	50 %	50 %	0 %	0 %	387126129
4606	NC_017857	CCG	2	6	240203	240208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126130
4607	NC_017857	CAT	2	6	240267	240272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126130
4608	NC_017857	AAT	2	6	240295	240300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126130
4609	NC_017857	TTA	2	6	240330	240335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126130
4610	NC_017857	GTT	2	6	240357	240362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126130
4611	NC_017857	ATT	2	6	240388	240393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126130
4612	NC_017857	TGC	2	6	240416	240421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126130
4613	NC_017857	A	6	6	240422	240427	100 %	0 %	0 %	0 %	387126130
4614	NC_017857	T	7	7	240432	240438	0 %	100 %	0 %	0 %	387126130
4615	NC_017857	CAC	2	6	240510	240515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126130
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4617	NC_017857	T	6	6	240672	240677	0 %	100 %	0 %	0 %	387126130
4618	NC_017857	CCG	3	9	240800	240808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126131
4619	NC_017857	ATG	2	6	240926	240931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126131
4620	NC_017857	AT	3	6	240979	240984	50 %	50 %	0 %	0 %	387126131
4621	NC_017857	CAT	2	6	241022	241027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126131
4622	NC_017857	TCA	2	6	241058	241063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126131
4623	NC_017857	GAC	2	6	241085	241090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126131
4624	NC_017857	TAA	2	6	241092	241097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126131
4625	NC_017857	GTT	2	6	241151	241156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126131
4626	NC_017857	T	6	6	241163	241168	0 %	100 %	0 %	0 %	387126131
4627	NC_017857	CG	3	6	241178	241183	0 %	0 %	50 %	50 %	387126131
4628	NC_017857	ATC	2	6	241251	241256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126131
4629	NC_017857	TCA	2	6	241384	241389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126131
4630	NC_017857	TCA	2	6	241411	241416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126131
4631	NC_017857	GCG	2	6	241486	241491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126131
4632	NC_017857	CTT	2	6	241493	241498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126131
4633	NC_017857	A	6	6	241587	241592	100 %	0 %	0 %	0 %	387126131
4634	NC_017857	TGG	2	6	241688	241693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126131
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4636	NC_017857	CAC	2	6	241829	241834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126131
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4651	NC_017857	GCC	2	6	242554	242559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126131
4652	NC_017857	CCA	3	9	242587	242595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126131
4653	NC_017857	CAT	2	6	242606	242611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126131
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4655	NC_017857	TTA	2	6	242747	242752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4656	NC_017857	A	7	7	242786	242792	100 %	0 %	0 %	0 %	387126132
4657	NC_017857	CTG	2	6	242890	242895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126132
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4660	NC_017857	CAG	2	6	242936	242941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126132
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4663	NC_017857	ATC	2	6	243160	243165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126133
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4681	NC_017857	T	6	6	243921	243926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4682	NC_017857	CAT	2	6	243935	243940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4684	NC_017857	TCA	2	6	243961	243966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4685	NC_017857	TTG	2	6	243972	243977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4686	NC_017857	CAA	2	6	244157	244162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4687	NC_017857	A	6	6	244167	244172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4688	NC_017857	GAG	2	6	244180	244185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4689	NC_017857	AAATGA	2	12	244190	244201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387126134
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4694	NC_017857	TATG	2	8	244321	244328	25 %	50 %	25 %	0 %	387126134
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4697	NC_017857	CA	3	6	244385	244390	50 %	0 %	0 %	50 %	387126134
4698	NC_017857	ATG	2	6	244523	244528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126134
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4716	NC_017857	GAG	2	6	245310	245315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4717	NC_017857	AAATC	2	10	245335	245344	60 %	20 %	0 %	20 %	387126136
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4726	NC_017857	CTG	2	6	245646	245651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126136
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4730	NC_017857	TATC	2	8	245773	245780	25 %	50 %	0 %	25 %	387126136
4731	NC_017857	TGC	3	9	245899	245907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126136
4732	NC_017857	GGTT	2	8	246032	246039	0 %	50 %	50 %	0 %	387126136
4733	NC_017857	CGG	2	6	246049	246054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126136
4734	NC_017857	TGC	2	6	246145	246150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126136
4735	NC_017857	CTGGT	2	10	246216	246225	0 %	40 %	40 %	20 %	387126136
4736	NC_017857	CTG	2	6	246234	246239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126136
4737	NC_017857	AC	3	6	246246	246251	50 %	0 %	0 %	50 %	387126136
4738	NC_017857	TGG	2	6	246286	246291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126136
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4740	NC_017857	CTG	2	6	246389	246394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126136
4741	NC_017857	ATC	2	6	246437	246442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126136
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4743	NC_017857	TTTG	2	8	246458	246465	0 %	75 %	25 %	0 %	387126136
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